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每小时处理80,000个蛋白质，大卫·贝克、微软等发布Seq2Symm，实现蛋白质对称性精准预测
蛋白质通常并非以单体形式发挥功能，而是组装成复杂的复合物。由多个相同蛋白质链通过非共价键相互作用形成的复合物被称为同源寡聚体，其空间排列呈现特定对称性，这对于蛋白质的稳定性、折叠和功能至关重要。然而，精确预测蛋白质可能形成的对称结构一直是生物信息学领域的难题。为此，微软、华盛顿大学和麻省理工学院等研究机构合作开发了一种名为Seq2Symm的新方法。该方法通过微调强大的蛋白质语言模型ESM2，实现了…- 2
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首个强化生成模型AbNovo实现多目标、多约束抗体从头设计，发表于ICLR 2025
上海交大医学院张海仓课题组联合中原人工智能产业技术研究院及中科院计算所，研发出一款名为abnovo的创新抗体设计工具。该工具巧妙地结合强化学习和深度扩散模型，能够在多重目标和约束条件下，高效完成抗体从头设计。这项研究成果已发表于国际顶级机器学习会议iclr 2025，论文标题为“multi-objective antibody design with constrained preference …- 2
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牛角梳蛋白质多的好还是少的好
牛角梳是生活中比较常见的一种梳子，它可以起到一定的保健效果，适量食用对身体有一定的好处，很多人都会用牛角梳。牛角梳上面会有蛋白质，但是不同类型的牛角梳蛋白质不一样，这个并不是判断品质好坏的一个标准。牛角梳蛋白质多的好还是少的好蛋白质含量并不是判断好坏的一个标准，不同材质的牛角梳的蛋白质含量都是不一样的，我们要根据材质、光泽、花纹以及重量等方面判断。市面上常见的牛角梳分为黄牛角梳、白水牛角梳、黑水牛…- 559.2k
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颠覆蛋白结构预测的AlphaFold 2，改变了科学史
牛津大学教授Matthew Higgins正在与一个经典的令人头痛的问题作斗争：蛋白质到底是什么样子的？自2005年以来，他的实验室就一直在关注于疟疾的相关问题。传统技术只能生成蛋白质结构的模糊轮廓，这让Higgins感到困惑。不过，通过使用一种名为AlphaFold 2的新人工智能技术，他破译了导致疟疾的寄生虫所使用的一种关键蛋白质的结构。这项突破帮助他开发了一种实验性疟疾疫苗，目前正在进行人体…- 4
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精度媲美AlphaFold，EPFL的AI方法从序列中匹配蛋白质互作
1. 蛋白质相互作用的重要性蛋白质是生命的基石，参与几乎所有生物过程。了解蛋白质如何相互作用对于解释细胞功能的复杂性至关重要。2. 新方法：配对相互作用的蛋白质序列洛桑联邦理工学院（EPFL）的 Anne-Florence Bitbol 团队提出了一种配对相互作用的蛋白质序列的方法。该方法利用了在多个序列比对上训练的蛋白质语言模型的强大功能。3. 方法优点该方法对于小型数据集表现良好，并且可以通过…- 3
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生成394,760种蛋白质表征，哈佛团队开发AI模型，全面理解蛋白质上下文
编辑 | 萝卜皮理解蛋白质功能并开发分子疗法，需要确定蛋白质发挥作用的细胞类型，并解析蛋白质之间的相互作用。然而，对跨生物背景的蛋白质相互作用进行建模，对于现有的算法而言仍然具有挑战性。在最新的研究中，哈佛医学院的研究人员开发了 PINNACLE，这是一种生成情境感知蛋白质表征的几何深度学习方法。PINNACLE 利用多器官单细胞图谱，在情境化蛋白质相互作用网络上进行学习，从 24 种组织的 15…- 4
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比原始分辨率高36倍，北航、清华团队用AI在多空间组学平台上高分辨率表征组织，登Nature子刊
空间组学数据增强框架 soScope1. 引言空间组学已扩展了分子类别分析的范围，但许多技术受到空间分辨率的限制。现有计算方法主要针对转录组学数据，缺乏对新兴空间组学技术的适应性。2. soScope 框架北京航空航天大学和清华大学的研究人员提出了 soScope，这是一个统一的生成框架，旨在提高空间组学数据的质量和分辨率。3. 技术原理soScope 汇总来自组学、空间关系和图像的多模态组织信息…- 3
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准确率84.09%，腾讯AI Lab发布Interformer，用于蛋白质-配体对接及亲和力预测，登Nature子刊
编辑 | 萝卜皮近年来，深度学习模型在蛋白质-配体对接和亲和力预测中的应用引起了越来越多的关注，而这两者都对基于结构的药物设计至关重要。然而，许多此类模型忽略了复合物中配体和蛋白质原子之间相互作用的复杂建模，从而限制了它们的泛化和可解释性。在最新的研究中，腾讯 AI Lab 的研究人员提出了 Interformer，这是一个基于 Graph-Transformer 架构的统一模型。该模型旨在利用交…- 3
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聚焦交叉创新研究，打造国际前沿高地！交大焕发新质生产力澎湃动能
上海交大自然科学研究院：交叉创新，人才培养，引领未来科技上海交通大学自然科学研究院（以下简称“研究院”）积极响应国家战略需求，面向世界科技前沿，在量子计算、分子动力学模拟、人工智能等多个领域取得一系列国际领先成果，并培养了一批杰出人才。 研究院注重交叉学科建设，鼓励自由探索和学术交流，为科技创新和高质量发展贡献力量。重大原创成果持续涌现研究院院长金石教授强调自由思考的重要性，认为思想碰撞能激发创新…- 4
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麦吉尔大学Ding Lab基于深度学习开发单细胞水平转座子位点表达定量模型，登Nature子刊
mates：深度学习赋能的单细胞转座子定量新工具突破性进展： 一篇发表在《Nature Communications》上的论文介绍了MATES，一款基于深度学习的单细胞水平转座子定量工具。MATES巧妙地利用自编码器模型，通过分析转座子周围独特比对reads的分布，概率性地将多重比对reads分配到特定位点，从而克服了传统方法在处理转座子重复序列时面临的挑战。该工具在多个单细胞测序平台（包括10X…- 3
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模拟5亿年进化的ESM3在Science发布了，可推理蛋白质序列、结构和功能
evolutionaryscale 公司的 esm3 模型，在《science》杂志上发表的研究成果震惊科学界！这款蛋白质语言大模型，成功设计出超越自然进化范畴的功能性蛋白，其模拟的进化历程长达5亿年。编辑 | 萝卜皮ESM3 模型于2024年夏季发布预印本，历经半年，最终以“模拟5亿年进化历程的语言模型”为题正式发表。研究人员利用海量进化数据训练 ESM3，使其能够生成远超已知蛋白质的功能性蛋白…- 4
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AI赋能蛋白质研究：SaprotHub让蛋白质AI模型训练和调用不再有门槛！
编辑 | scienceai近年来，AI 技术在蛋白质研究领域发挥了越来越重要的作用。从 AlphaFold2 在结构预测任务上的脱颖而出，到各类蛋白质语言模型（PLMs）在功能预测方面的重大进展，生物研究者们可以利用各式各样的 AI 模型来辅助他们的研究。然而，随着模型变得越来越复杂，如何训练和调用这些 AI 模型对于缺乏机器学习专业知识的研究者来说是一件非常具有挑战的任务，也因此限制了 AI …- 3
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高灵敏探索质谱，滑铁卢、中原AI院团队基于深度学习的端到端方法
深度学习赋能质谱蛋白质组学：deepsearch实现高灵敏度肽段鉴定准确鉴定肽段是基于质谱的蛋白质组学研究的关键，然而传统数据库搜索方法依赖启发式评分函数，鉴定率受限。加拿大滑铁卢大学和中原人工智能研究院的研究团队开发了DeepSearch，一种基于深度学习的端到端串联质谱数据库搜索方法，显著提升了肽段鉴定的准确性和效率。DeepSearch采用改进的Transformer编码器-解码器架构，并利…- 3
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老人补蛋白吃什么好 蛋白质补充过量好不好
蛋白质是人体最重要的营养素，一般通过食物可以补充蛋白质。老年人进食能力和对食物消化吸收的能力都有所降低，且更易出现营养素缺乏，那么老年人吃什么可以补充蛋白质呢？老人补蛋白吃什么好 首推豆腐因为豆腐是植物来源的优质蛋白质，蛋白质含量、质量均不错，且不含胆固醇，不会给血脂造成影响，且富含钙，对预防骨质疏松有好处。豆腐可以每天都吃，当然如果牙口、消化系统比较好，也可以吃豆腐皮、腐竹、香干等豆制品。建议天…- 23.2k
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肾有问题可以吃阿胶吗 肾病补充蛋白质怎么补充
肾病有很多种，有的还会有并发症。肾病需要保证优质蛋白的摄入，一般从日常饮食就足够了。那么有哪些补充来源呢？肾有问题可以吃阿胶吗通常建议慢性肾脏病患者进食低蛋白饮食，并保证一定量的优质蛋白摄入，而阿胶中含有的胶原蛋白不是优质蛋白。从这个角度来看，阿胶不适合慢性肾脏病患者食用。因此，对于慢性肾脏疾病患者，不建议吃阿胶。如果是肾性贫血仅可用药物增加促红细胞生成，可用于治疗肾性贫血。如果是缺铁性贫血，补铁…- 289.5k
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微波炉加热会损失营养吗 微波炉能加热蛋白质食物吗
现代家用厨房电器中，微波炉是比较常见的一种，它为我们的生活提供很多方便。微波炉，顾名思义，就是利用微波加热食品的一种烹饪厨具。很多人习惯于用传统加热方法，对微波炉总心存疑虑，认为微波加热会损失营养素或产生致癌物，对健康不利，事实真是这样的吗？微波炉加热会损失营养吗肉类中的维生素Ｂ２、维生素Ｂ６、烟酸以及食物中的维生素Ｃ在达到相同加热效果的情况下，保存率要高于传统加热方法，这得益于微波短时高效的加热…- 559.3k
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生蚝蛋白质含量高吗 生蚝蒸多长时间最好吃
生蚝蛋白质含量还是挺高的，对于喜欢吃生蚝的朋友们来说，可以定期吃，对身体好处很多，但是不能多吃，吃了会有副作用的。下面，我们来看看生蚝蒸多长时间最好吃，一起来看看本站提供的介绍！生蚝蛋白质含量高吗较高。生蚝是一种高蛋白、低脂肪的食材，其中每100克的生蚝中，含有10.9克蛋白质，脂肪只有1.5克，而且生蚝作为牡蛎的一种，含有锌的含量居高，每100克中含有71.2毫克锌，并且生蚝中的营养物质容易被人…- 654.6k
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蛋白质粉过期半年多了了还能喝吗
蛋白质粉可以补充蛋白质，一般来说平时饮食均衡的话，是不需要额外吃蛋白粉的，反而蛋白质补充多了并不好。而对于健身人群来说，一些人需要增肌就需要补充蛋白质。吃蛋白粉的话一定要注意生产日期，如果是过期了的蛋白质粉，最好就不要吃了，营养价值已经大不如前了。1、蛋白质粉过期半年多了了还能喝吗不建议再吃过期后的蛋白质，如果放置时间过长，其营养成分将减少60％。不管营养产品多么营养，过期之后它们的营养价值也都会…- 18.2k
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毛豆是蛋白质还是碳水化合物
毛豆是很常见的食材之一，特别到了夏天很多人都爱吃毛豆。很多人想知道毛豆是蛋白质还是碳水化合物，其实是属于蛋白质哦，减肥期间适量吃毛豆还好，吃多了还是会长胖的，请注意控制饮食。毛豆是蛋白质还是碳水化合物毛豆属于蛋白质。毛豆含有约40%的蛋白质，约20%的脂肪，并含有丰富的维生素，所以属于蛋白质。毛豆除可直接食用外，还可作酱料、酱油及各种豆类食品；茎、叶、豆粕和粗豆粕可作肥料和优良的牲畜饲料。减肥期间…- 688.6k
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双眼皮埋线是蛋白质还是尼龙绳
很多单眼皮妹子为了有一双水汪汪的大眼睛，会选择去做双眼皮。其中埋线是常见的一种医美方法，它用的缝线有很多材质，常见的就是蛋白线了，蛋白质线更能被我们的人体所接受，它的主要成分就是蛋白质，恢复时间相对较快。双眼皮埋线是蛋白质还是尼龙绳双眼皮埋线法一般会选择高分子蛋白线，由于手术时间短，恢复时间快，可以促进血液循环，可以减少手术过程中的肿胀和充血，因此它是较常用的选择，但也有其缺点。 蛋白质线包含人类…- 816.5k
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蚝油选蛋白质高的好还是低的好
蚝油可以做各种各样的美食，不仅可以炒菜，还可以用来用来拌馅吃等等，味道都是很不错的。不同的蚝油会有不同的配料表，里面的成分含量都是不一样的，有些蚝油蛋白质高一点，有些蚝油蛋白质低一点，一般蛋白质高的蚝油会更好一点。蚝油选蛋白质高的好还是低的好蚝油先蛋白质高的更好一点。蚝油的主要原料是牡蛎和水。牡蛎是海鲜。它们以新鲜著称。用水煮沸，浓缩成“精华”，最后给我们看看我们吃的蚝油。在煮牡蛎的过程中，牡蛎肉…- 830.5k
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活珠子是蛋白质还是脂肪
活珠子是生活中比较特别的一种食物，它吃起来味道很不错，含有多种营养成分，比如蛋白质、脂肪以及钙等微量元素等，适量食用对身体有一定好处。很多人都会吃活珠子，但是一次不能吃太多，也不适合长期食用，避免引起身体不适。活珠子是蛋白质还是脂肪含有蛋白质，也含有脂肪。活珠子富含蛋白质、脂肪、氨基酸、牛磺酸、钙等营养素。适当的消费对健康有益。然而，不当烹饪也会对人体造成伤害。虽然活珠子是尚未发育成雏鸡的鸡蛋，但…- 434k
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